בור הטוחן הוא החלק החשוב ביותר במטחנה. קוצני טוחן שונים יפיצו ישירות את קוטר אבקת הקפה. סוגי הטוחנים הקיימים כיום בכל מקום מתחלקים לציר חרוטי, קמצוץ שטוח ושירי רפאים.